События в фильме происходят спустя десять лет после того, как на Землю обрушился "Обезьяний грипп", уничтоживший людскую цивилизацию. Приматы стали разумными и теперь борются за доминирование с оставшимися в живых людьми. Небольшая группа выживших устроила свою базу в окрестностях Сан-Франциско. В это же время, шимпанзе по имени Цезарь собрал за собой единомышленников, которые занимаются охотой.
Во время очередной вылазки, юный Синеглаз и его друг Эш сталкиваются с вооруженным отрядом людей. Ранения Эша вызывают ярость и желание отомстить, но Цезарь понимает, что конфронтация может привести к большим потерям. Он приказывает своим подчиненным убраться со места схватки, несмотря на то, что Коба, один из его верных бойцов, жаждет крови и готов броситься в бой.
Некоторое время спустя, обезьяны вновь появляются в окрестностях базы людей, чтобы выдвинуть свой ультиматум. Отныне лес, населенный приматами, становится их территорией, куда чужакам запрещено входить. Но жители колонии все еще нуждаются в энергии, чтобы выживать, и мужчина по имени Малкольм решает попытаться договориться с обезьянами. Он приходит к ним с просьбой разрешить проход к гидро-электростанции, чтобы активизировать установки и обеспечить обе группы необходимой энергией.
Но не все готовы идти на мирные переговоры. Лидер обезьян, Коба, ненавидит людей и хочет лишь истребить их, видя в них угрозу для своего народа. С другой стороны, командующий базой людей, Дрейфус, решил подготовиться к полномасштабной войне с обезьянами, не веря в возможность мирного сосуществования. Каждая сторона готова пролить кровь ради своих целей и обострить текущую шаткую ситуацию.
Кто же победит в этой борьбе за выживание? Будут ли обезьяны и люди обречены на вечную вражду или найдется выход из этой тяжелой ситуации? Этот фильм раскроет многие важные вопросы о природе человеческих и животных инстинктов и о том, насколько важно сохранять мир и сотрудничество в мире после катастрофы.